MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-Eawag-EQ344602

Clarithromycin N-Oxide; LC-ESI-QFT; MS2; CE: 30; R=35000; [M+H]+

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-Eawag-EQ344602
RECORD_TITLE: Clarithromycin N-Oxide; LC-ESI-QFT; MS2; CE: 30; R=35000; [M+H]+
DATE: 2015.08.25
AUTHORS: Beck B, Stravs M, Schymanski E, Singer H, Department of Environmental Chemistry, Eawag
LICENSE: CC BY
COPYRIGHT: Copyright (C) 2015 Eawag, Duebendorf, Switzerland
COMMENT: CONFIDENCE standard compound
COMMENT: EAWAG_UCHEM_ID 3446

CH$NAME: Clarithromycin N-Oxide
CH$NAME: (2S,3R,4S,6R)-2-[[(3R,4S,5S,6R,7R,9R,11R,12R,13S,14R)-14-ethyl-12,13-dihydroxy-4-[(2R,4R,5S,6S)-5-hydroxy-4-methoxy-4,6-dimethyloxan-2-yl]oxy-7-methoxy-3,5,7,9,11,13-hexamethyl-2,10-dioxo-oxacyclotetradec-6-yl]oxy]-3-hydroxy-N,N,6-trimethyloxan-4-amine oxide
CH$COMPOUND_CLASS: N/A; Environmental Standard
CH$FORMULA: C38H69NO14
CH$EXACT_MASS: 763.47181
CH$SMILES: [O-][N+](C)(C)[C@H]3C[C@@H](C)O[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](C)[C@H](O[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1)[C@@H](C)C(=O)O[C@H](CC)[C@@](C)(O)[C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@@]2(C)OC)[C@@H]3O
CH$IUPAC: InChI=1S/C38H69NO14/c1-15-26-38(10,45)31(42)21(4)28(40)19(2)17-37(9,48-14)33(53-35-29(41)25(39(11,12)46)16-20(3)49-35)22(5)30(23(6)34(44)51-26)52-27-18-36(8,47-13)32(43)24(7)50-27/h19-27,29-33,35,41-43,45H,15-18H2,1-14H3/t19-,20-,21+,22+,23-,24+,25+,26-,27+,29-,30+,31-,32+,33-,35+,36-,37-,38-/m1/s1
CH$LINK: CAS 118074-07-0
CH$LINK: PUBCHEM CID:11320230
CH$LINK: INCHIKEY KDRPFIWYMNONLJ-KCBOHYOISA-N
CH$LINK: CHEMSPIDER 9495187
CH$LINK: COMPTOX DTXSID30891488

AC$INSTRUMENT: Q Exactive Plus Orbitrap Thermo Scientific
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QFT
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$MASS_SPECTROMETRY: FRAGMENTATION_MODE HCD
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 30 (nominal)
AC$MASS_SPECTROMETRY: RESOLUTION 35000
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME XBridge C18 3.5um, 2.1x50mm, Waters
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT 90/10 at 0 min, 50/50 at 4 min, 5/95 at 17 min, 5/95 at 25 min, 90/10 at 25.1 min, 90/10 at 30 min
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 200 ul/min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 9.7 min
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water with 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B methanol with 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: BASE_PEAK 764.4783
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 764.4791
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$DATA_PROCESSING: RECALIBRATE loess on assigned fragments and MS1
MS$DATA_PROCESSING: REANALYZE Peaks with additional N2/O included
MS$DATA_PROCESSING: WHOLE RMassBank 1.9.6

PK$SPLASH: splash10-05fr-1921001000-3c223d7390797df81a7f
PK$ANNOTATION: m/z tentative_formula formula_count mass error(ppm)
  55.0541 C4H7+ 1 55.0542 -1.94
  57.0333 C3H5O+ 1 57.0335 -3.18
  57.0698 C4H9+ 1 57.0699 -1.34
  58.0651 C3H8N+ 1 58.0651 -0.44
  59.0491 C3H7O+ 1 59.0491 -0.53
  60.0443 C2H6NO+ 1 60.0444 -1.17
  62.06 C2H8NO+ 1 62.06 -0.81
  65.0385 C5H5+ 1 65.0386 -0.87
  67.0542 C5H7+ 1 67.0542 -0.99
  69.0333 C4H5O+ 1 69.0335 -2.48
  69.0698 C5H9+ 1 69.0699 -1.11
  70.0651 C4H8N+ 1 70.0651 -0.79
  71.049 C4H7O+ 1 71.0491 -1.43
  71.0728 C4H9N+ 1 71.073 -1.7
  72.0443 C3H6NO+ 1 72.0444 -1.39
  72.0807 C4H10N+ 1 72.0808 -1.05
  73.0648 C4H9O+ 1 73.0648 -0.57
  74.06 C3H8NO+ 1 74.06 -1.22
  75.0439 C3H7O2+ 1 75.0441 -1.54
  79.054 C6H7+ 1 79.0542 -2.49
  81.0697 C6H9+ 1 81.0699 -1.69
  83.0491 C5H7O+ 1 83.0491 -0.86
  84.0807 C5H10N+ 1 84.0808 -0.31
  85.0283 C4H5O2+ 1 85.0284 -0.89
  85.0647 C5H9O+ 1 85.0648 -0.96
  86.06 C4H8NO+ 1 86.06 -0.82
  95.0491 C6H7O+ 1 95.0491 -0.43
  95.0855 C7H11+ 1 95.0855 -0.6
  97.0648 C6H9O+ 1 97.0648 -0.22
  98.0965 C6H12N+ 1 98.0964 0.35
  99.0678 C5H9NO+ 1 99.0679 -0.66
  99.0803 C6H11O+ 1 99.0804 -1.53
  99.1042 C6H13N+ 1 99.1043 -0.71
  100.112 C6H14N+ 1 100.1121 -0.66
  101.0233 C4H5O3+ 1 101.0233 -0.2
  102.0913 C5H12NO+ 1 102.0913 -0.59
  107.0854 C8H11+ 1 107.0855 -1
  109.0648 C7H9O+ 1 109.0648 -0.2
  109.1011 C8H13+ 1 109.1012 -0.34
  111.0438 C6H7O2+ 1 111.0441 -1.94
  111.0804 C7H11O+ 1 111.0804 -0.01
  111.1169 C8H15+ 1 111.1168 0.57
  112.1121 C7H14N+ 1 112.1121 0.22
  113.0596 C6H9O2+ 1 113.0597 -0.76
  114.0913 C6H12NO+ 1 114.0913 -0.27
  115.0753 C6H11O2+ 1 115.0754 -0.75
  116.0707 C5H10NO2+ 1 116.0706 0.47
  116.1069 C6H14NO+ 1 116.107 -0.35
  119.0853 C9H11+ 1 119.0855 -1.99
  121.1012 C9H13+ 1 121.1012 -0.22
  123.0803 C8H11O+ 1 123.0804 -0.82
  125.0597 C7H9O2+ 1 125.0597 -0.37
  125.096 C8H13O+ 1 125.0961 -0.41
  126.0912 C7H12NO+ 1 126.0913 -1.19
  127.0753 C7H11O2+ 1 127.0754 -0.68
  127.1116 C8H15O+ 1 127.1117 -0.88
  128.1069 C7H14NO+ 1 128.107 -0.78
  129.0546 C6H9O3+ 1 129.0546 0.07
  129.091 C7H13O2+ 1 129.091 -0.12
  130.0862 C6H12NO2+ 1 130.0863 -0.58
  132.0655 C5H10NO3+ 1 132.0655 -0.3
  133.1011 C10H13+ 1 133.1012 -0.73
  135.0803 C9H11O+ 1 135.0804 -0.97
  135.1165 C10H15+ 1 135.1168 -2.27
  137.096 C9H13O+ 1 137.0961 -0.38
  139.0752 C8H11O2+ 1 139.0754 -1.12
  139.1117 C9H15O+ 1 139.1117 -0.51
  140.1069 C8H14NO+ 1 140.107 -0.43
  141.0547 C7H9O3+ 1 141.0546 0.85
  141.0908 C8H13O2+ 1 141.091 -1.67
  143.0702 C7H11O3+ 1 143.0703 -0.49
  143.1068 C8H15O2+ 1 143.1067 1.08
  146.1175 C7H16NO2+ 1 146.1176 -0.58
  147.0803 C10H11O+ 1 147.0804 -1.17
  147.1168 C11H15+ 1 147.1168 -0.39
  149.0961 C10H13O+ 1 149.0961 0.26
  149.1324 C11H17+ 1 149.1325 -0.31
  151.0751 C9H11O2+ 1 151.0754 -1.63
  151.1117 C10H15O+ 1 151.1117 -0.01
  151.1483 C11H19+ 1 151.1481 1.48
  153.0909 C9H13O2+ 1 153.091 -0.37
  155.1065 C9H15O2+ 1 155.1067 -1.01
  156.1019 C8H14NO2+ 1 156.1019 -0.16
  157.0858 C8H13O3+ 1 157.0859 -0.7
  158.1175 C8H16NO2+ 1 158.1176 -0.35
  159.1169 C12H15+ 1 159.1168 0.27
  159.1252 C8H17NO2+ 1 159.1254 -0.94
  161.1322 C12H17+ 1 161.1325 -1.59
  163.0754 C10H11O2+ 1 163.0754 0.58
  163.1117 C11H15O+ 1 163.1117 -0.32
  165.0909 C10H13O2+ 1 165.091 -0.4
  165.1274 C11H17O+ 1 165.1274 -0.19
  167.1066 C10H15O2+ 1 167.1067 -0.34
  167.143 C11H19O+ 1 167.143 -0.49
  169.0858 C9H13O3+ 1 169.0859 -0.71
  169.1222 C10H17O2+ 1 169.1223 -0.39
  171.1015 C9H15O3+ 1 171.1016 -0.53
  173.1326 C13H17+ 1 173.1325 0.71
  174.1124 C8H16NO3+ 1 174.1125 -0.17
  175.1116 C12H15O+ 1 175.1117 -0.98
  177.1273 C12H17O+ 1 177.1274 -0.4
  179.1065 C11H15O2+ 1 179.1067 -0.87
  179.143 C12H19O+ 1 179.143 -0.4
  181.0857 C10H13O3+ 1 181.0859 -1.16
  181.1222 C11H17O2+ 1 181.1223 -0.64
  183.1015 C10H15O3+ 1 183.1016 -0.22
  183.1379 C11H19O2+ 1 183.138 -0.36
  185.1171 C10H17O3+ 1 185.1172 -0.76
  185.1325 C14H17+ 1 185.1325 0.12
  187.148 C14H19+ 1 187.1481 -0.52
  188.1283 C9H18NO3+ 1 188.1281 0.96
  189.127 C13H17O+ 1 189.1274 -2.18
  189.1636 C14H21+ 1 189.1638 -1.09
  191.1066 C12H15O2+ 1 191.1067 -0.19
  191.143 C13H19O+ 1 191.143 -0.11
  192.1229 C8H18NO4+ 1 192.123 -0.75
  193.1223 C12H17O2+ 1 193.1223 -0.14
  195.1379 C12H19O2+ 1 195.138 -0.24
  197.1172 C11H17O3+ 1 197.1172 0.1
  199.0964 C10H15O4+ 1 199.0965 -0.68
  199.1484 C15H19+ 1 199.1481 1.42
  201.1637 C15H21+ 1 201.1638 -0.33
  203.1065 C13H15O2+ 1 203.1067 -0.77
  203.1433 C14H19O+ 1 203.143 1.17
  205.1225 C13H17O2+ 1 205.1223 0.8
  205.1587 C14H21O+ 1 205.1587 -0.15
  207.1381 C13H19O2+ 1 207.138 0.69
  207.1741 C14H23O+ 1 207.1743 -1.22
  209.1171 C12H17O3+ 1 209.1172 -0.58
  209.1534 C13H21O2+ 1 209.1536 -0.84
  211.1328 C12H19O3+ 1 211.1329 -0.43
  213.1485 C12H21O3+ 1 213.1485 0.04
  215.143 C15H19O+ 1 215.143 -0.24
  217.1589 C15H21O+ 1 217.1587 1.1
  219.1382 C14H19O2+ 1 219.138 1.29
  219.1747 C15H23O+ 1 219.1743 1.45
  221.1172 C13H17O3+ 1 221.1172 -0.18
  221.1535 C14H21O2+ 1 221.1536 -0.39
  223.1331 C13H19O3+ 1 223.1329 1.03
  223.1693 C14H23O2+ 1 223.1693 0.11
  225.1642 C17H21+ 1 225.1638 1.74
  227.1789 C17H23+ 1 227.1794 -2.19
  229.1587 C16H21O+ 1 229.1587 -0.14
  231.1381 C15H19O2+ 1 231.138 0.71
  233.1535 C15H21O2+ 1 233.1536 -0.37
  235.1335 C14H19O3+ 1 235.1329 2.59
  235.1692 C15H23O2+ 1 235.1693 -0.2
  239.1277 C13H19O4+ 1 239.1278 -0.4
  243.1743 C17H23O+ 1 243.1743 -0.13
  245.1899 C17H25O+ 1 245.19 -0.29
  247.169 C16H23O2+ 1 247.1693 -0.96
  249.1484 C15H21O3+ 1 249.1485 -0.57
  251.1641 C15H23O3+ 1 251.1642 -0.44
  253.1589 C18H21O+ 1 253.1587 0.94
  259.133 C16H19O3+ 1 259.1329 0.38
  261.1486 C16H21O3+ 1 261.1485 0.42
  261.1848 C17H25O2+ 1 261.1849 -0.52
  263.2005 C17H27O2+ 1 263.2006 -0.25
  265.1799 C16H25O3+ 1 265.1798 0.26
  267.1588 C15H23O4+ 1 267.1591 -1.03
  271.1541 C14H23O5+ 1 271.154 0.44
  271.1688 C18H23O2+ 1 271.1693 -1.61
  277.1433 C16H21O4+ 1 277.1434 -0.42
  279.159 C16H23O4+ 1 279.1591 -0.38
  289.1797 C18H25O3+ 1 289.1798 -0.45
  291.1952 C18H27O3+ 1 291.1955 -0.93
  301.2166 C20H29O2+ 1 301.2162 1.34
  303.2316 C20H31O2+ 1 303.2319 -0.85
  307.1903 C18H27O4+ 1 307.1904 -0.34
  311.2007 C21H27O2+ 1 311.2006 0.36
  320.2067 C15H30NO6+ 1 320.2068 -0.11
  325.201 C18H29O5+ 1 325.201 0.24
  329.211 C21H29O3+ 1 329.2111 -0.34
  335.1852 C19H27O5+ 1 335.1853 -0.27
  339.2167 C19H31O5+ 1 339.2166 0.23
  347.2217 C21H31O4+ 1 347.2217 -0.05
  365.2323 C21H33O5+ 1 365.2323 0.05
  379.248 C22H35O5+ 1 379.2479 0.37
  383.2428 C21H35O6+ 1 383.2428 -0.12
  393.2272 C22H33O6+ 1 393.2272 0.01
  397.2585 C22H37O6+ 1 397.2585 0.06
  411.2377 C22H35O7+ 1 411.2377 -0.12
  425.2531 C23H37O7+ 1 425.2534 -0.75
  556.3483 C29H50NO9+ 1 556.348 0.43
  574.3586 C29H52NO10+ 2 574.3586 0.03
  588.3744 C30H54NO10+ 2 588.3742 0.35
  606.3848 C30H56NO11+ 1 606.3848 0.09
PK$NUM_PEAK: 190
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  55.0541 728207.1 6
  57.0333 1176383.4 10
  57.0698 397524.5 3
  58.0651 793221 6
  59.0491 203140.1 1
  60.0443 274070.5 2
  62.06 1504824.1 12
  65.0385 240896.3 2
  67.0542 2529629.5 21
  69.0333 636141.6 5
  69.0698 3466751 29
  70.0651 3477561.5 29
  71.049 343462.1 2
  71.0728 443835.4 3
  72.0443 258244.2 2
  72.0807 697932.8 5
  73.0648 242481.6 2
  74.06 235254.8 2
  75.0439 235759.7 2
  79.054 117844.4 1
  81.0697 490030 4
  83.0491 17006326 145
  84.0807 2201420.2 18
  85.0283 2065823.9 17
  85.0647 2372634.5 20
  86.06 2049264.8 17
  95.0491 3681471.2 31
  95.0855 770629.8 6
  97.0648 13060347 111
  98.0965 898617.9 7
  99.0678 248824.4 2
  99.0803 921032.6 7
  99.1042 793063.5 6
  100.112 4140545.2 35
  101.0233 121281.6 1
  102.0913 1457498.1 12
  107.0854 793618.5 6
  109.0648 4513018.5 38
  109.1011 5504483.5 47
  111.0438 623833.8 5
  111.0804 876389.9 7
  111.1169 544945.2 4
  112.1121 213258.8 1
  113.0596 51971644 444
  114.0913 16155406 138
  115.0753 2588193.2 22
  116.0707 657192.3 5
  116.1069 5324366.5 45
  119.0853 694238.7 5
  121.1012 15425703 131
  123.0803 116893504 999
  125.0597 994860.7 8
  125.096 5425001.5 46
  126.0912 340251.1 2
  127.0753 3793857 32
  127.1116 1839515.5 15
  128.1069 12381024 105
  129.0546 452356.7 3
  129.091 320183.4 2
  130.0862 220132.8 1
  132.0655 706165.5 6
  133.1011 318670.5 2
  135.0803 572566.8 4
  135.1165 845339.6 7
  137.096 8919133 76
  139.0752 703038.2 6
  139.1117 2951589.2 25
  140.1069 357656.8 3
  141.0547 217855.3 1
  141.0908 569893.6 4
  143.0702 1786441.5 15
  143.1068 182791 1
  146.1175 3012326.5 25
  147.0803 224663 1
  147.1168 1084213.6 9
  149.0961 310900.2 2
  149.1324 4935977.5 42
  151.0751 647023.8 5
  151.1117 805536.4 6
  151.1483 249684.1 2
  153.0909 6201213.5 52
  155.1065 2388719.5 20
  156.1019 8310007.5 71
  157.0858 1374110.1 11
  158.1175 4567342 39
  159.1169 1510645 12
  159.1252 287556 2
  161.1322 394013.6 3
  163.0754 242725.4 2
  163.1117 2717829 23
  165.0909 4144949 35
  165.1274 2730203.5 23
  167.1066 696091.3 5
  167.143 4266630 36
  169.0858 1403832.5 11
  169.1222 590133.4 5
  171.1015 5524024.5 47
  173.1326 332020.5 2
  174.1124 25848458 220
  175.1116 1453834.2 12
  177.1273 10654963 91
  179.1065 1096339.6 9
  179.143 578960.3 4
  181.0857 1417989.1 12
  181.1222 3616276.5 30
  183.1015 14093948 120
  183.1379 1166359.8 9
  185.1171 973141.8 8
  185.1325 199879.1 1
  187.148 1955437.4 16
  188.1283 210748.4 1
  189.127 344783.9 2
  189.1636 676262.2 5
  191.1066 315856.9 2
  191.143 337725.5 2
  192.1229 7306694.5 62
  193.1223 11899563 101
  195.1379 15850967 135
  197.1172 1931752.5 16
  199.0964 1300987 11
  199.1484 262425.6 2
  201.1637 590246.2 5
  203.1065 881821.1 7
  203.1433 621681.6 5
  205.1225 425837 3
  205.1587 5373049.5 45
  207.1381 434197.9 3
  207.1741 520306.3 4
  209.1171 359913.8 3
  209.1534 748538.5 6
  211.1328 2561585.8 21
  213.1485 1568259.1 13
  215.143 1228097.4 10
  217.1589 647232.9 5
  219.1382 119455.1 1
  219.1747 238318.6 2
  221.1172 8226840.5 70
  221.1535 2455032 20
  223.1331 693615.6 5
  223.1693 2363352.5 20
  225.1642 118626.6 1
  227.1789 389653.3 3
  229.1587 768167.2 6
  231.1381 1094266 9
  233.1535 8604043 73
  235.1335 252192.4 2
  235.1692 949484.9 8
  239.1277 6137866 52
  243.1743 1016230.3 8
  245.1899 5126225.5 43
  247.169 704224.4 6
  249.1484 1797098.1 15
  251.1641 10510071 89
  253.1589 442760.2 3
  259.133 545430.5 4
  261.1486 223403.3 1
  261.1848 1181582.6 10
  263.2005 7076443 60
  265.1799 1222986.2 10
  267.1588 623012.7 5
  271.1541 323437.8 2
  271.1688 2364464.2 20
  277.1433 1350258.2 11
  279.159 6069489 51
  289.1797 19357440 165
  291.1952 1763946.6 15
  301.2166 495856.2 4
  303.2316 487988.5 4
  307.1903 20888978 178
  311.2007 291927.1 2
  320.2067 251165.6 2
  321.206 2659823 22
  325.201 1350095.8 11
  329.211 2535034.5 21
  335.1852 5915497.5 50
  339.2167 541547.5 4
  347.2217 11447831 97
  353.1959 1971875.125 16
  365.2323 19304502 164
  379.248 5967088.5 50
  383.2428 3670041.8 31
  393.2272 9862391 84
  397.2585 313743.3 2
  411.2377 3207023.2 27
  425.2531 555671 4
  538.3374 1574236.875 13
  556.3483 2161153.8 18
  574.3586 9410035 80
  588.3744 452462 3
  606.3848 52430236 448
//

system version 2.2.5
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo