MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR310655

Germbudine; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR310655
RECORD_TITLE: Germbudine; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: Annotation level-1

CH$NAME: Germbudine
CH$COMPOUND_CLASS: Alkaloids
CH$FORMULA: C37H59NO12
CH$EXACT_MASS: 709.874
CH$SMILES: CCC(C)C(=O)OC1C(O)C2C(CN3CC(C)CCC3C2(C)O)C2CC34OC5(O)C(CC(O)C3C12O)C4(C)CCC5OC(=O)C(C)(O)C(C)O
CH$IUPAC: InChI=1S/C37H59NO12/c1-8-18(3)30(42)49-29-27(41)26-20(16-38-15-17(2)9-10-24(38)34(26,7)45)21-14-35-28(36(21,29)46)22(40)13-23-32(35,5)12-11-25(37(23,47)50-35)48-31(43)33(6,44)19(4)39/h17-29,39-41,44-47H,8-16H2,1-7H3
CH$LINK: INCHIKEY LWSPRPDSPCBAKK-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 4.65
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 710.411

PK$SPLASH: splash10-03di-0000012900-5ad2b1621929c7281577
PK$NUM_PEAK: 428
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  89.06099 23.0 0
  98.75224 19.0 0
  105.03257 23.0 0
  112.11179 25.0 0
  126.08845 22.0 0
  136.1114 21.0 0
  154.11119 35.0 0
  154.12624 313.0 4
  155.12798 60.0 1
  172.13023 22.0 0
  202.1203 26.0 0
  207.10266 30.0 0
  210.15482 48.0 1
  211.8476 18.0 0
  218.88605 29.0 0
  227.12502 24.0 0
  231.79134 17.0 0
  240.13318 23.0 0
  245.76906 23.0 0
  260.17245 41.0 1
  264.15662 25.0 0
  265.85663 21.0 0
  267.1196 20.0 0
  273.5687 24.0 0
  279.13794 68.0 1
  279.15179 18.0 0
  281.14005 28.0 0
  290.38834 24.0 0
  291.13925 18.0 0
  294.97156 18.0 0
  297.14462 40.0 1
  310.88382 20.0 0
  311.70508 71.0 1
  315.17355 23.0 0
  318.31006 18.0 0
  323.17084 20.0 0
  327.79684 18.0 0
  330.20169 18.0 0
  331.67441 20.0 0
  332.22296 26.0 0
  334.20108 21.0 0
  334.21933 32.0 0
  344.37726 17.0 0
  349.17163 18.0 0
  351.57489 18.0 0
  352.90179 22.0 0
  360.50638 25.0 0
  365.1741 24.0 0
  368.49948 32.0 0
  374.87042 17.0 0
  375.98697 25.0 0
  376.22748 18.0 0
  378.15579 33.0 0
  378.2287 18.0 0
  379.35211 20.0 0
  380.99646 17.0 0
  383.13937 18.0 0
  384.54251 21.0 0
  385.45901 17.0 0
  385.73914 18.0 0
  386.98157 27.0 0
  387.49615 28.0 0
  389.49603 27.0 0
  389.6611 40.0 1
  390.23019 40.0 1
  391.35461 21.0 0
  391.98495 18.0 0
  392.24536 20.0 0
  393.2717 20.0 0
  393.53537 28.0 0
  393.60995 18.0 0
  394.25525 22.0 0
  395.30325 17.0 0
  396.43015 44.0 1
  397.20972 21.0 0
  398.23788 20.0 0
  400.11429 17.0 0
  402.37689 19.0 0
  403.75415 27.0 0
  404.24249 17.0 0
  405.25107 17.0 0
  406.26315 20.0 0
  406.54031 18.0 0
  407.26797 19.0 0
  407.83783 17.0 0
  408.23572 17.0 0
  408.24857 66.0 1
  410.77707 17.0 0
  410.84174 20.0 0
  411.28659 21.0 0
  411.35394 27.0 0
  411.88107 19.0 0
  412.27167 22.0 0
  412.47073 22.0 0
  415.24719 34.0 0
  415.88809 24.0 0
  417.08453 25.0 0
  417.19272 33.0 0
  417.70605 18.0 0
  418.29623 23.0 0
  418.92725 24.0 0
  419.2883 18.0 0
  420.19485 23.0 0
  420.23581 57.0 1
  420.25803 17.0 0
  422.23807 24.0 0
  424.18085 36.0 0
  426.86636 18.0 0
  428.27539 21.0 0
  429.2605 21.0 0
  430.27097 17.0 0
  433.20486 17.0 0
  433.39249 20.0 0
  434.09094 23.0 0
  434.24811 31.0 0
  434.26468 21.0 0
  435.66977 17.0 0
  438.20618 30.0 0
  438.22772 17.0 0
  438.25955 330.0 4
  438.29111 21.0 0
  439.13745 18.0 0
  439.22678 28.0 0
  439.24237 59.0 1
  439.27515 36.0 0
  440.29071 22.0 0
  440.63831 43.0 1
  446.45169 17.0 0
  447.90155 17.0 0
  453.29636 17.0 0
  456.21094 23.0 0
  456.23431 96.0 1
  456.27689 1033.0 13
  456.30014 179.0 2
  456.40927 29.0 0
  456.87479 29.0 0
  457.26773 114.0 1
  457.28461 277.0 4
  458.0824 18.0 0
  458.13464 25.0 0
  458.27139 76.0 1
  458.29315 20.0 0
  460.69867 18.0 0
  461.84457 19.0 0
  462.48206 22.0 0
  466.47534 28.0 0
  468.31464 22.0 0
  471.22852 21.0 0
  471.49405 19.0 0
  474.20972 18.0 0
  474.28296 769.0 10
  474.33286 19.0 0
  474.51108 22.0 0
  475.15326 17.0 0
  475.27768 152.0 2
  475.2941 244.0 3
  475.59558 33.0 0
  476.28531 18.0 0
  476.30496 25.0 0
  477.30896 21.0 0
  480.28177 37.0 0
  480.76743 17.0 0
  482.85123 26.0 0
  483.90738 18.0 0
  486.52298 34.0 0
  488.62518 21.0 0
  488.6431 33.0 0
  490.31827 75.0 1
  491.67041 25.0 0
  492.24902 18.0 0
  492.26483 24.0 0
  492.64899 25.0 0
  492.92831 24.0 0
  497.10526 19.0 0
  498.26559 18.0 0
  498.37433 21.0 0
  499.79483 23.0 0
  502.71423 22.0 0
  504.27414 21.0 0
  506.26694 17.0 0
  510.29425 19.0 0
  514.01727 17.0 0
  516.33032 21.0 0
  521.18188 26.0 0
  523.32581 32.0 0
  524.33026 19.0 0
  524.34869 32.0 0
  526.34253 17.0 0
  527.19409 18.0 0
  528.30585 23.0 0
  528.34741 18.0 0
  530.32739 29.0 0
  531.05817 21.0 0
  533.95569 28.0 0
  535.19196 21.0 0
  535.61237 36.0 0
  536.29034 50.0 1
  536.30847 29.0 0
  540.30042 31.0 0
  540.3504 36.0 0
  540.41681 35.0 0
  541.3374 46.0 1
  542.3219 28.0 0
  542.3432 63.0 1
  543.32373 28.0 0
  543.62244 24.0 0
  545.30273 20.0 0
  546.41107 20.0 0
  547.15088 24.0 0
  548.67096 43.0 1
  552.27277 18.0 0
  553.31635 27.0 0
  554.29443 91.0 1
  554.31665 257.0 3
  554.35577 44.0 1
  555.32642 64.0 1
  555.34924 40.0 1
  556.30408 17.0 0
  557.6709 21.0 0
  557.91718 19.0 0
  558.22394 25.0 0
  558.26196 50.0 1
  558.28601 68.0 1
  558.33978 2952.0 37
  558.40765 49.0 1
  559.16022 27.0 0
  559.24963 47.0 1
  559.27606 17.0 0
  559.31891 124.0 2
  559.34692 763.0 10
  559.37634 86.0 1
  559.40247 20.0 0
  559.63312 18.0 0
  559.68176 18.0 0
  559.77472 35.0 0
  559.79877 17.0 0
  560.24927 23.0 0
  560.34021 132.0 2
  560.36548 75.0 1
  560.38727 28.0 0
  561.31586 27.0 0
  561.35217 55.0 1
  561.37256 34.0 0
  561.98462 24.0 0
  562.37268 20.0 0
  570.81335 17.0 0
  572.27606 23.0 0
  572.31024 267.0 3
  572.32965 661.0 8
  572.37244 21.0 0
  572.4057 28.0 0
  573.03552 20.0 0
  573.18201 17.0 0
  573.26007 20.0 0
  573.2995 17.0 0
  573.33044 257.0 3
  573.71613 17.0 0
  574.33221 21.0 0
  575.50592 20.0 0
  575.87189 24.0 0
  576.3089 45.0 1
  576.341 158.0 2
  576.36676 100.0 1
  576.39526 33.0 0
  577.11273 19.0 0
  577.31177 20.0 0
  577.34955 210.0 3
  577.38074 60.0 1
  577.40289 17.0 0
  578.34241 17.0 0
  578.35651 45.0 1
  578.38452 20.0 0
  578.49005 20.0 0
  578.95721 20.0 0
  579.34674 17.0 0
  580.37988 21.0 0
  581.93372 21.0 0
  582.0686 23.0 0
  582.28571 17.0 0
  585.26819 26.0 0
  588.3988 18.0 0
  590.2724 17.0 0
  590.33508 697.0 9
  591.29651 25.0 0
  591.33527 188.0 2
  592.34729 17.0 0
  592.37836 18.0 0
  593.18439 17.0 0
  593.34375 25.0 0
  595.36859 20.0 0
  596.4342 36.0 0
  600.31989 20.0 0
  604.73242 19.0 0
  608.33057 22.0 0
  608.35223 27.0 0
  608.39124 20.0 0
  609.33746 24.0 0
  609.35889 18.0 0
  609.50916 20.0 0
  612.0697 18.0 0
  612.46576 19.0 0
  617.06342 21.0 0
  622.97382 18.0 0
  625.90808 22.0 0
  626.73724 21.0 0
  626.86029 17.0 0
  627.11017 23.0 0
  628.37769 17.0 0
  628.95386 18.0 0
  629.71393 22.0 0
  630.34882 19.0 0
  630.81232 18.0 0
  631.35449 21.0 0
  633.68225 19.0 0
  636.9184 48.0 1
  638.32654 17.0 0
  639.35614 25.0 0
  640.39789 18.0 0
  642.78711 55.0 1
  644.70105 20.0 0
  648.37317 29.0 0
  650.78656 29.0 0
  651.66644 27.0 0
  652.9035 18.0 0
  653.39136 17.0 0
  654.0354 20.0 0
  654.13281 26.0 0
  654.63306 21.0 0
  656.08075 38.0 0
  656.36798 148.0 2
  656.38708 65.0 1
  656.41241 20.0 0
  657.41455 17.0 0
  658.33826 20.0 0
  658.38025 20.0 0
  661.42371 17.0 0
  664.5412 18.0 0
  668.5578 17.0 0
  670.50885 20.0 0
  673.94403 21.0 0
  674.28937 17.0 0
  674.31744 42.0 1
  674.38391 447.0 6
  674.40991 411.0 5
  674.53912 17.0 0
  675.32593 19.0 0
  675.39929 413.0 5
  675.46942 38.0 0
  676.38696 38.0 0
  676.41748 22.0 0
  677.99841 20.0 0
  679.26819 18.0 0
  679.95093 18.0 0
  680.7179 35.0 0
  691.40338 18.0 0
  691.60962 24.0 0
  691.98773 18.0 0
  692.19781 37.0 0
  692.24573 18.0 0
  692.2771 60.0 1
  692.30469 72.0 1
  692.33752 147.0 2
  692.40125 13357.0 169
  692.48236 73.0 1
  692.54492 18.0 0
  692.59454 20.0 0
  692.63184 25.0 0
  693.12238 20.0 0
  693.24628 19.0 0
  693.28485 84.0 1
  693.31128 73.0 1
  693.33881 90.0 1
  693.40601 5407.0 69
  693.45337 108.0 1
  694.16119 18.0 0
  694.20563 19.0 0
  694.28143 44.0 1
  694.32422 17.0 0
  694.4115 1640.0 21
  694.83112 17.0 0
  695.22614 21.0 0
  695.39362 217.0 3
  695.41986 104.0 1
  696.07227 38.0 0
  696.25427 18.0 0
  696.41046 75.0 1
  696.44635 27.0 0
  696.55707 18.0 0
  696.77966 17.0 0
  696.91339 18.0 0
  697.07678 17.0 0
  697.10858 33.0 0
  697.73065 17.0 0
  699.56055 25.0 0
  700.15942 24.0 0
  700.30035 17.0 0
  701.66058 34.0 0
  702.82605 17.0 0
  703.07855 24.0 0
  703.5 18.0 0
  703.70679 18.0 0
  704.03625 17.0 0
  704.32574 18.0 0
  706.33002 30.0 0
  706.78235 18.0 0
  707.0528 19.0 0
  707.07996 17.0 0
  707.19971 23.0 0
  707.65143 17.0 0
  708.12897 37.0 0
  708.37811 50.0 1
  708.84558 36.0 0
  709.19275 23.0 0
  709.38818 24.0 0
  709.40765 35.0 0
  709.49866 23.0 0
  709.57123 34.0 0
  710.00055 22.0 0
  710.03534 50.0 1
  710.07031 21.0 0
  710.17938 17.0 0
  710.20544 58.0 1
  710.2467 161.0 2
  710.2951 396.0 5
  710.33319 568.0 7
  710.41254 78818.0 999
  710.49194 994.0 13
  710.56573 72.0 1
//

system version 2.2.5
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo