MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR311099

Camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR311099
RECORD_TITLE: Camptothecin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: Annotation level-3

CH$NAME: Camptothecin
CH$COMPOUND_CLASS: Carbolines
CH$FORMULA: C20H16N2O4
CH$EXACT_MASS: 348.358
CH$SMILES: O=C2OCC=1C(=O)N4C(=CC=1C2(O)CC)C3=NC=5C=CC=CC=5(C=C3C4)
CH$IUPAC: InChI=1S/C20H16N2O4/c1-2-20(25)14-8-16-17-12(7-11-5-3-4-6-15(11)21-17)9-22(16)18(23)13(14)10-26-19(20)24/h3-8,25H,2,9-10H2,1H3
CH$LINK: INCHIKEY VSJKWCGYPAHWDS-UHFFFAOYSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 5.4
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 349.1191

PK$SPLASH: splash10-0udi-0089000000-9aef75e9b63416ddc981
PK$NUM_PEAK: 210
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  107.04852 20.0 2
  143.08044 16.0 2
  149.03 17.0 2
  155.06343 18.0 2
  166.05219 16.0 2
  166.06784 21.0 2
  167.06488 38.0 4
  167.08455 22.0 2
  168.0752 22.0 2
  177.13022 24.0 3
  178.06709 20.0 2
  180.06628 23.0 2
  180.08766 32.0 3
  181.07527 137.0 14
  181.08621 32.0 3
  182.08134 21.0 2
  184.09221 18.0 2
  189.26054 16.0 2
  191.06667 16.0 2
  192.06906 17.0 2
  193.07805 18.0 2
  194.49879 16.0 2
  195.09857 17.0 2
  198.44136 28.0 3
  198.47203 18.0 2
  202.06851 18.0 2
  203.05521 27.0 3
  204.0699 81.0 8
  204.0798 22.0 2
  205.06017 17.0 2
  205.08292 59.0 6
  206.09015 32.0 3
  209.06775 71.0 7
  216.08127 16.0 2
  217.07414 38.0 4
  217.08759 73.0 8
  217.09763 34.0 4
  217.10826 20.0 2
  217.4946 17.0 2
  218.08392 276.0 29
  218.10747 16.0 2
  218.82718 17.0 2
  219.08958 270.0 28
  219.11179 17.0 2
  219.60281 16.0 2
  220.09004 35.0 4
  220.0976 31.0 3
  220.1104 18.0 2
  220.14886 16.0 2
  221.10085 36.0 4
  222.11528 22.0 2
  222.5237 16.0 2
  224.75591 20.0 2
  224.9323 17.0 2
  228.07613 70.0 7
  228.09741 18.0 2
  229.08818 41.0 4
  230.08022 19.0 2
  230.09267 68.0 7
  230.10129 58.0 6
  231.09576 203.0 21
  231.10863 54.0 6
  232.0782 51.0 5
  232.10004 113.0 12
  232.10947 187.0 20
  233.06963 17.0 2
  233.09227 35.0 4
  233.1071 84.0 9
  233.67296 16.0 2
  234.08417 37.0 4
  234.11346 18.0 2
  235.0764 16.0 2
  241.09416 16.0 2
  242.06757 16.0 2
  242.0939 171.0 18
  242.11201 16.0 2
  243.03941 36.0 4
  243.08643 45.0 5
  243.10031 65.0 7
  243.10706 133.0 14
  244.09886 427.0 45
  244.11877 96.0 10
  245.08073 48.0 5
  245.09329 34.0 4
  245.1048 27.0 3
  245.11436 71.0 7
  245.12459 32.0 3
  246.07628 16.0 2
  246.11517 108.0 11
  246.99838 17.0 2
  247.08717 213.0 22
  247.12595 109.0 11
  248.08357 37.0 4
  248.09467 162.0 17
  248.12822 26.0 3
  248.13896 18.0 2
  249.09691 54.0 6
  249.1416 17.0 2
  250.10159 17.0 2
  250.1116 17.0 2
  255.0916 57.0 6
  255.10672 31.0 3
  256.07275 18.0 2
  256.10303 70.0 7
  256.11465 16.0 2
  257.08136 17.0 2
  257.10492 132.0 14
  257.11444 64.0 7
  257.72812 21.0 2
  258.08313 22.0 2
  258.10007 16.0 2
  258.11172 53.0 6
  259.07028 16.0 2
  259.08444 87.0 9
  259.11679 186.0 19
  259.13348 73.0 8
  260.07379 73.0 8
  260.09894 91.0 10
  260.12445 109.0 11
  260.13312 32.0 3
  260.16797 20.0 2
  261.11008 83.0 9
  261.14923 24.0 3
  262.09958 20.0 2
  266.09299 38.0 4
  267.10355 61.0 6
  267.97369 20.0 2
  268.09274 17.0 2
  270.07983 16.0 2
  270.1185 20.0 2
  271.07803 35.0 4
  271.09641 16.0 2
  272.0676 16.0 2
  272.08301 121.0 13
  272.09842 238.0 25
  272.13199 20.0 2
  273.06927 46.0 5
  273.09869 266.0 28
  273.11661 32.0 3
  273.23236 18.0 2
  274.07132 253.0 27
  274.09891 18.0 2
  274.11511 92.0 10
  275.04938 17.0 2
  275.07315 178.0 19
  275.08475 139.0 15
  275.12021 1502.0 157
  275.15118 32.0 3
  276.06915 18.0 2
  276.08197 83.0 9
  276.09561 19.0 2
  276.12128 367.0 38
  277.12732 101.0 11
  277.147 17.0 2
  278.12213 16.0 2
  283.07526 17.0 2
  284.08908 73.0 8
  285.08551 52.0 5
  285.1026 392.0 41
  285.51187 18.0 2
  286.09482 46.0 5
  286.10406 80.0 8
  286.12021 47.0 5
  287.04291 20.0 2
  287.07516 88.0 9
  287.12106 2327.0 244
  288.08685 73.0 8
  288.11813 533.0 56
  288.13425 137.0 14
  289.10062 32.0 3
  289.11453 17.0 2
  289.13565 34.0 4
  290.11386 19.0 2
  290.12436 16.0 2
  292.07211 37.0 4
  299.66107 16.0 2
  299.83087 17.0 2
  300.09561 18.0 2
  301.09363 16.0 2
  301.10785 30.0 3
  301.12207 17.0 2
  302.10721 57.0 6
  302.58652 16.0 2
  303.02124 20.0 2
  303.06516 20.0 2
  303.11417 9533.0 999
  303.15387 18.0 2
  303.24374 20.0 2
  304.11517 2526.0 265
  304.14771 17.0 2
  304.55463 18.0 2
  305.10938 131.0 14
  305.12695 384.0 40
  305.15512 17.0 2
  305.23615 18.0 2
  306.12311 25.0 3
  306.13885 37.0 4
  307.12134 18.0 2
  312.6134 16.0 2
  313.09476 19.0 2
  313.10718 39.0 4
  320.07819 33.0 3
  320.09253 25.0 3
  321.08627 21.0 2
  331.09091 68.0 7
  331.11145 487.0 51
  331.25894 21.0 2
  332.11511 162.0 17
  333.11234 17.0 2
  347.58176 31.0 3
//

system version 2.2.5
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo