MassBank Record: PR303982

Home Search Record Index

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303982
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-0002-0689100000-591da13130c294858b87
PK$NUM_PEAK: 292
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  77.03709 8.0 8
  79.17729 9.0 9
  85.02806 11.0 11
  98.031 10.0 10
  109.06868 9.0 9
  115.05515 15.0 15
  117.06815 44.0 44
  117.07506 16.0 16
  117.27039 6.0 6
  123.03662 8.0 8
  123.04313 6.0 6
  125.06015 17.0 17
  125.22266 6.0 6
  127.05061 9.0 9
  128.05441 6.0 6
  131.03648 8.0 8
  131.04732 15.0 15
  132.05388 9.0 9
  133.06541 13.0 13
  133.58533 7.0 7
  135.03798 23.0 23
  135.04343 29.0 29
  135.05037 9.0 9
  138.03395 9.0 9
  138.0687 9.0 9
  143.04626 31.0 31
  143.05612 13.0 13
  145.0645 220.0 220
  146.06891 51.0 51
  147.04164 23.0 23
  147.06897 12.0 12
  149.02859 20.0 20
  151.03534 21.0 21
  152.0428 13.0 13
  153.02934 7.0 7
  153.0507 24.0 24
  155.04834 7.0 7
  155.05879 7.0 7
  155.94504 10.0 10
  159.97929 8.0 8
  160.04831 26.0 26
  161.05882 47.0 47
  161.78685 9.0 9
  166.06372 8.0 8
  168.08696 15.0 15
  169.07867 44.0 44
  169.08762 31.0 31
  170.08479 8.0 8
  171.04959 32.0 32
  172.0477 6.0 6
  172.05891 13.0 13
  173.04756 14.0 14
  173.05969 154.0 154
  173.9269 9.0 9
  174.05469 7.0 7
  174.06416 24.0 24
  174.12981 8.0 8
  175.04546 6.0 6
  175.07394 18.0 18
  175.08522 11.0 11
  177.05122 9.0 9
  181.08226 34.0 34
  182.08986 7.0 7
  185.03336 7.0 7
  185.05922 445.0 445
  185.07808 12.0 12
  186.06639 91.0 91
  186.18771 6.0 6
  187.06651 8.0 8
  187.082 6.0 6
  188.0295 6.0 6
  188.03905 8.0 8
  189.04767 50.0 50
  189.05905 35.0 35
  189.53658 6.0 6
  189.9646 7.0 7
  190.0645 29.0 29
  195.06367 19.0 19
  196.06859 16.0 16
  197.05486 8.0 8
  198.08328 8.0 8
  200.04272 6.0 6
  200.0564 6.0 6
  201.02507 8.0 8
  201.05197 74.0 74
  202.06711 7.0 7
  203.07076 88.0 88
  203.08496 15.0 15
  204.07175 18.0 18
  205.06752 7.0 7
  210.06563 6.0 6
  215.03583 6.0 6
  215.08896 8.0 8
  218.96492 7.0 7
  219.05226 15.0 15
  219.06859 122.0 122
  219.17859 10.0 10
  220.06467 24.0 24
  220.07478 12.0 12
  226.08331 13.0 13
  227.07153 7.0 7
  228.03145 6.0 6
  228.9751 7.0 7
  229.02509 17.0 17
  229.05183 372.0 372
  230.05168 41.0 41
  232.10681 8.0 8
  233.05791 14.0 14
  235.0717 7.0 7
  235.08272 7.0 7
  237.03189 7.0 7
  238.06145 20.0 20
  239.05095 6.0 6
  239.06032 9.0 9
  239.07472 11.0 11
  240.09915 6.0 6
  246.04915 7.0 7
  247.06036 738.0 737
  247.08084 13.0 13
  248.06302 104.0 104
  248.09125 9.0 9
  249.06161 36.0 36
  249.07776 26.0 26
  250.06119 8.0 8
  251.07874 7.0 7
  252.09888 7.0 7
  254.06432 13.0 13
  255.06134 13.0 13
  259.08676 17.0 17
  260.08304 15.0 15
  261.09897 8.0 8
  261.20868 7.0 7
  262.07108 7.0 7
  263.07547 8.0 8
  263.08466 16.0 16
  264.09378 7.0 7
  264.11157 7.0 7
  265.04062 8.0 8
  267.05136 7.0 7
  267.07129 15.0 15
  269.08078 26.0 26
  270.09576 7.0 7
  272.07645 6.0 6
  275.0498 9.0 9
  275.06961 7.0 7
  275.09015 9.0 9
  276.07455 20.0 20
  276.10095 20.0 20
  277.0817 16.0 16
  277.20212 9.0 9
  278.09753 19.0 19
  279.05936 9.0 9
  280.08765 9.0 9
  281.07574 6.0 6
  282.06259 8.0 8
  282.08807 218.0 218
  282.10495 28.0 28
  282.11603 8.0 8
  282.22964 6.0 6
  282.78271 8.0 8
  283.03467 6.0 6
  283.05951 9.0 9
  283.07413 23.0 23
  283.09131 58.0 58
  284.06784 7.0 7
  284.10199 7.0 7
  289.09158 30.0 30
  290.09256 24.0 24
  290.11426 7.0 7
  291.0564 6.0 6
  291.07358 6.0 6
  291.09656 13.0 13
  292.07489 22.0 22
  292.90582 9.0 9
  297.07455 18.0 18
  297.08713 15.0 15
  297.76984 7.0 7
  298.07788 27.0 27
  298.08752 26.0 26
  299.0939 26.0 26
  303.06601 28.0 28
  304.05939 11.0 11
  304.07751 9.0 9
  305.08093 19.0 19
  305.8472 6.0 6
  306.07446 22.0 22
  306.09219 84.0 84
  307.07489 11.0 11
  307.0975 36.0 36
  307.11121 7.0 7
  308.10086 25.0 25
  309.06668 7.0 7
  309.08804 7.0 7
  312.09271 38.0 38
  312.10944 14.0 14
  312.12262 6.0 6
  312.73499 6.0 6
  313.08414 17.0 17
  313.10272 157.0 157
  313.11508 96.0 96
  314.10309 29.0 29
  314.11923 23.0 23
  319.08447 6.0 6
  319.09662 9.0 9
  319.11938 21.0 21
  320.04172 7.0 7
  320.0647 6.0 6
  320.10663 24.0 24
  320.1265 8.0 8
  321.07385 16.0 16
  321.10046 16.0 16
  321.1254 7.0 7
  322.09052 7.0 7
  322.11148 31.0 31
  322.1268 14.0 14
  323.08899 17.0 17
  323.10315 8.0 8
  323.12158 9.0 9
  324.10464 6.0 6
  324.12262 9.0 9
  329.11295 8.0 8
  329.69934 6.0 6
  332.06998 14.0 14
  333.07663 19.0 19
  334.06021 12.0 12
  334.07843 10.0 10
  335.05685 9.0 9
  335.08545 11.0 11
  335.10806 6.0 6
  336.08719 21.0 21
  336.10397 26.0 26
  337.06622 6.0 6
  337.09085 7.0 7
  337.10681 23.0 23
  337.21011 6.0 6
  337.62238 7.0 7
  337.67255 12.0 12
  338.08496 14.0 14
  338.1304 12.0 12
  339.11688 9.0 9
  340.11615 6.0 6
  340.35889 6.0 6
  345.32877 6.0 6
  347.10321 7.0 7
  348.07428 7.0 7
  348.0914 7.0 7
  348.10303 7.0 7
  348.11911 8.0 8
  348.15784 8.0 8
  349.07169 19.0 19
  349.10733 12.0 12
  351.10574 12.0 12
  351.12662 37.0 37
  352.12363 26.0 26
  352.13315 16.0 16
  353.14301 20.0 20
  354.10522 8.0 8
  355.10938 13.0 13
  355.13715 31.0 31
  356.12674 6.0 6
  364.10309 6.0 6
  364.11572 6.0 6
  365.08774 6.0 6
  366.06314 8.0 8
  366.10132 32.0 32
  367.08521 6.0 6
  367.10565 25.0 25
  367.68045 6.0 6
  373.12479 9.0 9
  376.50171 7.0 7
  379.11285 21.0 21
  379.12534 43.0 43
  380.12122 37.0 37
  381.08881 6.0 6
  381.10693 10.0 10
  383.10736 8.0 8
  386.14447 7.0 7
  397.09549 17.0 17
  397.12943 1000.0 999
  397.2215 13.0 13
  398.13095 250.0 250
  399.09991 6.0 6
  399.11774 18.0 18
  399.14066 8.0 8
  400.11749 9.0 9
  400.95505 6.0 6
  414.09619 7.0 7
  414.12128 123.0 123
  414.13632 147.0 147
  415.09674 23.0 23
  415.11649 25.0 25
  415.1377 148.0 148
//