MassBank Record: PR303992

Home Search Record Index

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: PR303992
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-SA NC
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-001a-0975000000-ddea68340f4fec5758c2
PK$NUM_PEAK: 301
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  69.03621 10.0 10
  85.02942 45.0 45
  91.05306 24.0 24
  106.9058 10.0 10
  110.04021 12.0 12
  115.05323 48.0 48
  117.06683 122.0 122
  117.07191 149.0 149
  118.07271 10.0 10
  120.08652 12.0 12
  122.03429 38.0 38
  123.04686 38.0 38
  129.06616 18.0 18
  131.05179 27.0 27
  131.83141 9.0 9
  133.06696 20.0 20
  134.00838 9.0 9
  135.04257 75.0 75
  136.04869 13.0 13
  138.06584 24.0 24
  139.07022 15.0 15
  143.0477 64.0 64
  144.05081 24.0 24
  145.04628 12.0 12
  145.06606 571.0 570
  146.06999 77.0 77
  146.07753 25.0 25
  147.04054 75.0 75
  147.05138 17.0 17
  147.08279 10.0 10
  149.01559 25.0 25
  151.03899 57.0 57
  152.04189 24.0 24
  153.05045 124.0 124
  154.06047 30.0 30
  154.06999 12.0 12
  155.04323 25.0 25
  155.05444 9.0 9
  155.07352 11.0 11
  158.02089 13.0 13
  159.04362 75.0 75
  160.04375 15.0 15
  160.05309 10.0 10
  160.08786 16.0 16
  161.06041 122.0 122
  161.07138 10.0 10
  162.07115 10.0 10
  163.0372 20.0 20
  165.26776 11.0 11
  166.02286 12.0 12
  166.05783 32.0 32
  167.06635 21.0 21
  167.07709 28.0 28
  168.07338 30.0 30
  168.08125 46.0 46
  169.07942 11.0 11
  169.08946 66.0 66
  171.04015 33.0 33
  172.04475 13.0 13
  172.70494 10.0 10
  173.06137 237.0 237
  174.05759 10.0 10
  174.0706 25.0 25
  174.84927 9.0 9
  175.04361 27.0 27
  175.07439 288.0 288
  176.08942 19.0 19
  177.05727 10.0 10
  177.08069 9.0 9
  179.03029 15.0 15
  179.87703 10.0 10
  181.08623 29.0 29
  184.04521 9.0 9
  184.05367 10.0 10
  185.05989 1000.0 999
  186.05988 88.0 88
  186.06956 77.0 77
  187.04146 31.0 31
  188.04796 150.0 150
  188.13739 9.0 9
  189.05328 228.0 228
  190.05672 53.0 53
  191.0322 13.0 13
  191.05513 12.0 12
  191.07619 9.0 9
  192.0762 10.0 10
  192.99591 10.0 10
  193.0415 10.0 10
  193.50819 10.0 10
  194.04926 12.0 12
  195.05362 30.0 30
  195.06499 58.0 58
  195.07343 28.0 28
  196.06911 49.0 49
  197.06235 17.0 17
  198.08859 14.0 14
  199.03119 34.0 34
  199.04361 50.0 50
  200.04733 19.0 19
  200.12988 13.0 13
  201.03282 9.0 9
  201.05461 165.0 165
  202.06413 70.0 70
  203.06885 46.0 46
  203.0791 28.0 28
  204.21304 9.0 9
  205.07347 9.0 9
  205.8235 9.0 9
  207.10361 15.0 15
  211.92827 11.0 11
  213.0619 12.0 12
  216.24811 12.0 12
  218.38071 9.0 9
  218.42091 11.0 11
  219.04967 20.0 20
  219.06505 203.0 203
  220.05716 15.0 15
  220.06818 18.0 18
  220.07819 30.0 30
  222.09851 11.0 11
  224.08047 18.0 18
  225.03494 11.0 11
  227.35925 10.0 10
  229.02863 12.0 12
  229.04196 89.0 89
  229.05096 268.0 268
  230.05058 38.0 38
  231.06003 21.0 21
  232.09885 12.0 12
  236.07152 10.0 10
  237.05516 15.0 15
  239.06409 39.0 39
  239.07585 17.0 17
  241.05325 9.0 9
  241.08856 15.0 15
  246.0565 11.0 11
  247.04469 31.0 31
  247.05919 124.0 124
  248.06194 50.0 50
  248.08087 13.0 13
  248.09879 14.0 14
  249.09404 35.0 35
  251.04054 12.0 12
  252.07579 17.0 17
  253.08031 17.0 17
  254.05325 16.0 16
  255.07719 12.0 12
  259.07355 23.0 23
  260.07568 14.0 14
  261.07651 12.0 12
  263.06229 15.0 15
  263.07144 14.0 14
  263.10745 10.0 10
  267.06516 62.0 62
  268.06885 16.0 16
  269.07626 22.0 22
  269.13 12.0 12
  270.05588 27.0 27
  270.07013 11.0 11
  274.06268 9.0 9
  274.07303 9.0 9
  275.06949 41.0 41
  275.09702 61.0 61
  276.07202 15.0 15
  277.04694 10.0 10
  277.09018 19.0 19
  278.0477 14.0 14
  278.09259 34.0 34
  279.06189 10.0 10
  279.07449 23.0 23
  282.0788 176.0 176
  282.09073 586.0 585
  283.0184 27.0 27
  283.05157 40.0 40
  283.0636 129.0 129
  283.08667 22.0 22
  283.10144 41.0 41
  283.11697 9.0 9
  284.05432 11.0 11
  284.10043 22.0 22
  285.06332 15.0 15
  285.95728 12.0 12
  288.81265 12.0 12
  289.08267 28.0 28
  289.09088 53.0 53
  290.08945 90.0 90
  290.10687 9.0 9
  291.06848 61.0 61
  291.10489 80.0 80
  292.04544 10.0 10
  292.06955 27.0 27
  292.08389 9.0 9
  292.10593 20.0 20
  293.08722 13.0 13
  293.12042 10.0 10
  294.12607 13.0 13
  295.06744 9.0 9
  295.09921 28.0 28
  297.07013 46.0 46
  297.0809 46.0 46
  298.08606 239.0 239
  299.05978 10.0 10
  299.07587 24.0 24
  299.09314 60.0 60
  300.09769 11.0 11
  304.06879 20.0 20
  304.0813 10.0 10
  305.08191 55.0 55
  305.09616 9.0 9
  305.12787 14.0 14
  306.05087 12.0 12
  306.07736 84.0 84
  306.09302 132.0 132
  306.4021 11.0 11
  307.09256 142.0 142
  307.11099 12.0 12
  307.32971 9.0 9
  308.08737 14.0 14
  308.10367 32.0 32
  309.07516 26.0 26
  309.10059 18.0 18
  309.12582 9.0 9
  310.0722 18.0 18
  311.08228 13.0 13
  311.13696 15.0 15
  312.06961 9.0 9
  312.09537 88.0 88
  313.07083 11.0 11
  313.08801 31.0 31
  313.10226 79.0 79
  314.1127 10.0 10
  314.12018 19.0 19
  315.064 13.0 13
  316.11963 14.0 14
  317.08444 11.0 11
  319.08636 42.0 42
  319.10263 29.0 29
  320.07501 31.0 31
  320.09863 133.0 133
  320.11618 65.0 65
  321.05273 14.0 14
  321.08047 64.0 64
  321.11237 123.0 123
  321.13489 13.0 13
  322.07159 81.0 81
  322.1087 28.0 28
  322.12793 76.0 76
  323.07413 11.0 11
  323.09677 30.0 30
  323.1221 22.0 22
  323.13351 9.0 9
  324.09732 10.0 10
  325.07785 12.0 12
  325.10068 33.0 33
  325.82736 12.0 12
  327.11969 27.0 27
  328.98492 13.0 13
  329.10309 51.0 51
  333.05862 10.0 10
  333.06973 20.0 20
  334.08139 43.0 43
  335.09515 72.0 72
  336.10437 68.0 68
  337.09875 28.0 28
  337.11792 50.0 50
  338.09045 18.0 18
  338.10361 24.0 24
  338.12119 15.0 15
  339.12082 11.0 11
  341.15094 10.0 10
  344.54709 9.0 9
  346.07593 16.0 16
  347.07617 24.0 24
  347.08398 12.0 12
  348.10297 57.0 57
  348.79404 9.0 9
  349.07263 55.0 55
  349.10349 18.0 18
  349.63937 10.0 10
  350.0618 19.0 19
  351.09827 33.0 33
  351.12778 29.0 29
  352.13818 14.0 14
  354.10333 63.0 63
  356.11432 17.0 17
  356.12628 28.0 28
  364.06821 16.0 16
  364.10751 31.0 31
  365.0842 13.0 13
  365.10361 10.0 10
  365.11972 17.0 17
  366.10263 47.0 47
  366.11932 10.0 10
  367.10181 9.0 9
  367.12051 9.0 9
  369.14368 49.0 49
  371.13416 9.0 9
  379.11313 11.0 11
  400.32095 13.0 13
  415.09299 32.0 32
  415.12741 16.0 16
//