MassBank MassBank Search Contents Download

MassBank Record: MSBNK-RIKEN-PR303986

(-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2

Mass Spectrum
Chemical Structure
Generated by the Chemistry Development Kit (http://github.com/cdk)

ACCESSION: MSBNK-RIKEN-PR303986
RECORD_TITLE: (-)-Podophyllotoxin; LC-ESI-QTOF; MS2
DATE: 2019.03.28
AUTHORS: Tetsuya Mori, Center for Sustainable Resource Science, RIKEN
LICENSE: CC BY-NC-SA
PUBLICATION: Tsugawa H., Nakabayashi R., Mori T., Yamada Y., Takahashi M., Rai A., Sugiyama R., Yamamoto H., Nakaya T., Yamazaki M., Kooke R., Bac-Molenaar JA., Oztolan-Erol N., Keurentjes JJB., Arita M., Saito K. (2019) "A cheminformatics approach to characterize metabolomes in stable-isotope-labeled organisms" Nature Methods 16(4):295-298. [doi:10.1038/s41592-019-0358-2]
COMMENT: registered in RIKEN PlaSMA

CH$NAME: (-)-Podophyllotoxin
CH$COMPOUND_CLASS: Podophyllotoxins
CH$FORMULA: C22H22O8
CH$EXACT_MASS: 414.41
CH$SMILES: COC1=CC(=CC(OC)=C1OC)[C@H]1[C@@H]2[C@H](COC2=O)[C@@H](O)C2=CC3=C(OCO3)C=C12
CH$IUPAC: InChI=1S/C22H22O8/c1-25-16-4-10(5-17(26-2)21(16)27-3)18-11-6-14-15(30-9-29-14)7-12(11)20(23)13-8-28-22(24)19(13)18/h4-7,13,18-20,23H,8-9H2,1-3H3/t13-,18+,19-,20-/m0/s1
CH$LINK: INCHIKEY YJGVMLPVUAXIQN-XVVDYKMHSA-N

AC$INSTRUMENT: LC, Waters Acquity UPLC System; MS, Waters Xevo G2 Q-Tof
AC$INSTRUMENT_TYPE: LC-ESI-QTOF
AC$MASS_SPECTROMETRY: MS_TYPE MS2
AC$MASS_SPECTROMETRY: ION_MODE POSITIVE
AC$MASS_SPECTROMETRY: COLLISION_ENERGY 6V
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_GAS_FLOW 800/h
AC$MASS_SPECTROMETRY: DESOLVATION_TEMPERATURE 450 C
AC$MASS_SPECTROMETRY: IONIZATION ESI
AC$CHROMATOGRAPHY: CAPILLARY_VOLTAGE +3.00 kV
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_NAME Acquity bridged ethyl hybrid C18 (1.7 um, 2.1 mm * 100 mm, Waters)
AC$CHROMATOGRAPHY: COLUMN_TEMPERATURE 40 C
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_GRADIENT A/B = (99.5%/0.5% at 0 min, 99.5%/0.5% at 0.1 min, 20%/80% at 10 min, 0.5%/99.5% at 10.1 min, 0.5%/99.5% at 12.0 min, 99.5%/0.5% at 12.1 min, 99.5%/0.5% at 15.0 min)
AC$CHROMATOGRAPHY: FLOW_RATE 0.3 ml/min at 0 min, 0.3 ml/min at 10 min, 0.4 ml/min at 10.1 min, 0.4 ml/min at 14.4 min, 0.3 ml/min at 14.5 min
AC$CHROMATOGRAPHY: RETENTION_TIME 6.26135
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT A water including 0.1% formic acid
AC$CHROMATOGRAPHY: SOLVENT B acetonitrile including 0.1% formic acid

MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_TYPE [M+H]+
MS$FOCUSED_ION: PRECURSOR_M/Z 415.1387441

PK$SPLASH: splash10-0002-0689200000-f3b7abacc302cbf2f30d
PK$NUM_PEAK: 272
PK$PEAK: m/z int. rel.int.
  85.03114 16.0 16
  91.05355 13.0 13
  105.07224 5.0 5
  108.0499 12.0 12
  115.05191 22.0 22
  117.06767 61.0 61
  117.07935 6.0 6
  118.07262 11.0 11
  122.03568 13.0 13
  123.0304 9.0 9
  126.21149 7.0 7
  127.04524 6.0 6
  131.03616 6.0 6
  131.04742 11.0 11
  132.0569 7.0 7
  133.07013 21.0 21
  134.06598 6.0 6
  135.04343 43.0 43
  136.05685 9.0 9
  138.06644 5.0 5
  139.07213 7.0 7
  143.04716 24.0 24
  143.05908 5.0 5
  145.05849 35.0 35
  145.06525 156.0 156
  145.07639 14.0 14
  145.20401 7.0 7
  146.07008 16.0 16
  147.04672 9.0 9
  148.05107 6.0 6
  151.03523 15.0 15
  151.08667 7.0 7
  153.05225 14.0 14
  154.05142 5.0 5
  154.06152 5.0 5
  155.04785 6.0 6
  159.04443 11.0 11
  159.48447 6.0 6
  161.05016 7.0 7
  161.06088 34.0 34
  162.0309 6.0 6
  165.0742 9.0 9
  166.06065 7.0 7
  166.06941 9.0 9
  167.07059 7.0 7
  169.07379 11.0 11
  169.0853 80.0 80
  170.08347 10.0 10
  172.05733 12.0 12
  172.2034 7.0 7
  173.05634 48.0 48
  175.03592 13.0 13
  175.05354 11.0 11
  175.06161 8.0 8
  175.07719 40.0 40
  176.05078 6.0 6
  176.07802 13.0 13
  177.06006 10.0 10
  177.08755 6.0 6
  181.05341 12.0 12
  181.09378 7.0 7
  181.56223 5.0 5
  182.08337 6.0 6
  182.09047 9.0 9
  184.38843 6.0 6
  185.05954 550.0 549
  185.08209 8.0 8
  186.06325 58.0 58
  187.04445 17.0 17
  187.06242 15.0 15
  188.04773 44.0 44
  189.03247 8.0 8
  189.04922 38.0 38
  189.05936 40.0 40
  189.06563 14.0 14
  190.05807 16.0 16
  191.89635 9.0 9
  193.97285 8.0 8
  195.06898 30.0 30
  196.06894 6.0 6
  199.03485 14.0 14
  200.03998 6.0 6
  200.04994 12.0 12
  201.05505 93.0 93
  202.06267 12.0 12
  203.05106 5.0 5
  203.06326 14.0 14
  203.07378 38.0 38
  204.07724 10.0 10
  205.05016 6.0 6
  208.0638 7.0 7
  209.07672 6.0 6
  215.03683 7.0 7
  219.05243 11.0 11
  219.06851 87.0 87
  220.07195 36.0 36
  220.09079 8.0 8
  221.63184 6.0 6
  223.06845 6.0 6
  225.05415 6.0 6
  226.07719 16.0 16
  226.08989 6.0 6
  229.04973 368.0 368
  229.29094 7.0 7
  230.04468 14.0 14
  230.0528 11.0 11
  231.05486 7.0 7
  234.10574 10.0 10
  236.08038 7.0 7
  237.05121 7.0 7
  237.1068 6.0 6
  238.0565 20.0 20
  239.06664 28.0 28
  240.04301 8.0 8
  240.07677 8.0 8
  241.10577 8.0 8
  243.76624 5.0 5
  247.06093 783.0 782
  247.08908 14.0 14
  248.06564 97.0 97
  249.04352 9.0 9
  250.04024 6.0 6
  253.08585 7.0 7
  253.09828 7.0 7
  255.06635 6.0 6
  256.07129 6.0 6
  259.05646 5.0 5
  262.0889 7.0 7
  262.09918 15.0 15
  262.10788 10.0 10
  262.46707 8.0 8
  263.0654 17.0 17
  263.07761 8.0 8
  263.10358 10.0 10
  265.0419 5.0 5
  267.06891 35.0 35
  267.09186 5.0 5
  269.07892 11.0 11
  270.08646 5.0 5
  274.06592 7.0 7
  275.03809 6.0 6
  276.06897 14.0 14
  276.08374 14.0 14
  277.08386 40.0 40
  277.09604 14.0 14
  278.09866 6.0 6
  279.05823 9.0 9
  281.90915 7.0 7
  282.06223 10.0 10
  282.09122 193.0 193
  283.02316 6.0 6
  283.06128 31.0 31
  283.08832 6.0 6
  283.10889 11.0 11
  284.07129 13.0 13
  289.07867 5.0 5
  289.08926 13.0 13
  290.0929 15.0 15
  291.04935 11.0 11
  291.06485 39.0 39
  291.0853 7.0 7
  291.51791 5.0 5
  292.08151 22.0 22
  292.11853 15.0 15
  293.07492 12.0 12
  295.06223 5.0 5
  296.06345 5.0 5
  296.10007 15.0 15
  297.37775 6.0 6
  298.05151 7.0 7
  298.06854 18.0 18
  298.08405 24.0 24
  299.08386 7.0 7
  300.08374 11.0 11
  303.06436 13.0 13
  305.06842 7.0 7
  305.08597 23.0 23
  306.06824 15.0 15
  306.08469 35.0 35
  306.09567 37.0 37
  307.07224 15.0 15
  307.09323 23.0 23
  308.10941 8.0 8
  309.08517 7.0 7
  309.09741 5.0 5
  309.1225 6.0 6
  310.07712 7.0 7
  312.09747 39.0 39
  313.04648 7.0 7
  313.09274 23.0 23
  313.10995 184.0 184
  313.15384 5.0 5
  314.08588 7.0 7
  314.12094 15.0 15
  318.06931 7.0 7
  319.08347 9.0 9
  319.09851 13.0 13
  320.06116 6.0 6
  320.07925 13.0 13
  320.1001 13.0 13
  321.07034 15.0 15
  321.10349 18.0 18
  321.12006 38.0 38
  321.18411 8.0 8
  322.0845 6.0 6
  322.11871 27.0 27
  323.10379 11.0 11
  323.11813 5.0 5
  326.11603 9.0 9
  329.10895 17.0 17
  333.08414 10.0 10
  333.12222 5.0 5
  334.07715 8.0 8
  335.08109 6.0 6
  335.09064 6.0 6
  336.09714 17.0 17
  337.08905 5.0 5
  337.10825 12.0 12
  338.09879 6.0 6
  347.09714 9.0 9
  348.09183 7.0 7
  348.10953 26.0 26
  349.06613 10.0 10
  349.09473 5.0 5
  349.11597 10.0 10
  350.07333 13.0 13
  350.34384 7.0 7
  351.12512 131.0 131
  352.10004 7.0 7
  352.11801 18.0 18
  352.13135 10.0 10
  353.14243 11.0 11
  354.10114 7.0 7
  354.11533 5.0 5
  355.07474 5.0 5
  355.12436 14.0 14
  355.13858 6.0 6
  356.1145 7.0 7
  364.08527 7.0 7
  365.08139 5.0 5
  365.10678 17.0 17
  366.11053 13.0 13
  366.12317 8.0 8
  369.13205 7.0 7
  369.14377 6.0 6
  369.19217 5.0 5
  370.13861 14.0 14
  378.09125 7.0 7
  379.12268 92.0 92
  380.10825 12.0 12
  380.13678 16.0 16
  381.10864 7.0 7
  382.09912 5.0 5
  383.1069 8.0 8
  396.70142 9.0 9
  397.07382 7.0 7
  397.12921 1000.0 999
  397.17389 9.0 9
  398.13217 220.0 220
  399.12192 50.0 50
  399.14249 15.0 15
  400.13531 6.0 6
  400.1557 5.0 5
  400.32373 5.0 5
  403.67554 5.0 5
  404.62137 8.0 8
  414.12497 146.0 146
  414.13754 183.0 183
  415.09109 7.0 7
  415.11432 21.0 21
  415.13068 87.0 87
  415.14059 137.0 137
//

system version 2.2.7
Copyright © 2006 MassBank Project; 2011 NORMAN Association; 2021 MassBank Consortium
de.NBI logo
EAWAG logo
fnr logo
IPB logo
NORMAN logo
UFZ logo
LCSB logo
HBM4EU logo
nfdi4chem logo